桐树基因专注于肿瘤诊断的研发、出产、发卖一体化，依托“多平台结构”的策略，先后开辟了肿瘤微卫星不不变MSI、ctDNA等多款沉磅IVD诊断试剂盒。以NGS微量建库手艺为焦点壁垒的基因检测办事、以肿瘤基因组学标本库为根本的大数据研究核心建立了其外行业中的合作劣势，并努力于成为千亿级的精准医学肿瘤市场的带领者之一。

使用TIDE模子评价分歧TMEscore亚型免疫医治的临床疗效。通过Kaplan-Meier阐发，EC中TIDE评分高的亚型取TIDE评分低的亚型比拟，无进展期要短得多。然而低 TIDE 评分亚型和高TIDE评分亚型的预测效率无显著差别（图5A）。基于ROC曲线 的TMB评分的预测结果取TMEscore无显著差别（图5B）。TMEscore和TMB均可用于预测EC患者的，且成果分歧。

越来越多的表白 TME 正在肿瘤预后中起着至关主要的感化，而且取各类恶性肿瘤的患者相关。然而，目前关于若何无效地利用 TME 来更好地评估食管癌 (EC) 患者预后的研究很少。本研究引入“TMEscore”的概念，切磋TME能否能够做为生物标记物来评估患者的预后。

基于160个食管癌样本数据取消息，采用单变量Cox回归阐发TMEscore取患者并对预后进行评估。22种免疫细胞特征取TMEscore亚型的联系关系阐发如图1A所示。肿瘤-免疫细胞间彼此感化及其取的相关性如图1B所示。基于Cox回归模子计较TMEscores, 进一步阐发TMEscore取关系，发觉TMEscore-high的患者相较于TMEscore-low的患者预后更好（图1D）。

对基因组不不变性进行阐发，基于GISTIC对CNVs阐发发觉TMEscore-low的患者染色体形态更不不变。按照CNV成果，操纵ABSOLUTE软件进行肿瘤纯度和倍性阐发显示，基因组紊乱是肿瘤发生过程中常见的现象（图4C、4D）。分歧TMEscore亚型正在肿瘤纯度和倍性方面无显著差别。

而且TMEscore分类无效地预测了 EC 患者的预后，我们开辟了TME signarure来分析评估TME，这可能对识别EC 患者处于风险高、低亚组具有主要意义。

本研究收集TCGA中160例食管癌患者的数据，包罗RNA-seq数据、SNP、CNV、miRNA微阵列数据、甲基化微阵列数据及其带有消息的响应临床数据。建立了TMEscore模子，将样天职为TMEscore-high和TMEscore-low两个亚型，而且对两个亚型的遗传特征、TMEscore取食管癌预后的相关性进行阐发。

4. 基因组不不变性正在肿瘤微中遍及存正在，而且TMEscore-low亚型患者相较于TMEscore-high亚型患者的染色体形态更不不变。